Με την εξωσωματική γονιμοποίηση σε φυσικό κύκλο, το ίδιο το σώμα, φυσιολογικά, επιλέγει το καλύτερο, το πιο ισχυρό ωάριο. Η ανάπτυξη και η ωρίμανση του παρακολουθείται υπερηχογραφικά και η ωοληψία πραγματοποιείται σχεδόν ακριβώς την ημέρα που θα πραγματοποιείτο φυσιολογικά η ωορρηξία.